亞足聯關於奧運足球預賽的賽程安排打亂了聯賽安排。2003年甲A聯賽開始的時間很可能確定在3月16日,甲B聯賽推遲一周。到4月中旬,聯賽將進入第一次休賽期,時間可能是兩周。5月3日,中國國奧隊將與敘利亞隊和巴基斯坦隊之間的勝者進行首場比賽。第二場比賽是在6月7日,兩場比賽之間中國足協聯賽部計劃恢復兩三輪聯賽。聯賽第三階段是從6月中旬開始,到8月下旬結束。如果國奧隊從奧運足球預賽第二階段出線,將從8月30日到10月18日,參加奧運足球預選賽第三階段比賽(十二強賽),聯賽將第三次暫停。10月下旬,聯賽第四階段開始,到11月底,30輪甲A,26輪甲B聯賽全部結束。
和聯賽的老樣子相比,2003年的足協杯變化非常大。比賽時間安排和參賽隊數量、賽制,都會發生變化。明年的足協杯開始時間將提前到來年聯賽開始前,足協杯將在2月進行預賽。這個階段,將有32支球隊分成四個小組集中在四個城市進行賽會制比賽。分組和承辦比賽的城市數量現在都沒有最後確定,也可能分成三個小組在三個城市進行比賽。比賽產生足協杯的16強隊伍後暫時結束,聯賽間隙的4月、5月、6月、9月,足協杯比賽繼續進行。十一期間,將進行足協杯的決賽。明年參加足協杯的隊伍,將有32支。除了15支甲A隊伍、14支甲B隊伍,還有三支經過挑選的乙級隊伍。