賽季前，喬丹有兩個心願：打滿本賽季全部比賽；率領奇纔隊進軍季後賽。如今他卻一個也沒辦到。當地時間4月4日，深受膝傷折磨的喬丹宣布退出本賽季剩下的比賽，而此時的奇纔隊也已基本退出了季後賽的競爭。喬丹這一年，留下了一個苦澀的結尾。

　　榮耀

　　喬丹以區區100萬美元的年薪，平均每場貢獻近30分，而且所到之處場場爆滿，成為聯盟中性能價格比最高的球員。

　　喬丹讓奇纔隊成為全聯盟進步最快的球隊，上賽季奇纔隊統共只贏下19場，而今年奇纔在全明星周末前已有26勝在握；漢密爾頓進步了，瓊斯進步了，惠特尼和亞歷山大也變得異常可怕……。湖人隊的科比說：『喬丹讓奇纔隊變成了一支受人尊敬的球隊，喬丹在39歲時還能有如此出眾的發揮，我覺得真的不可思議。』

　　喬丹由得分後衛改打小前鋒。年輕時，喬丹的投籃點集中在籃下和禁區附近，而本賽季喬丹以中遠距離投籃為主，而且更多承擔起組織進攻的任務，1998年喬丹在公牛隊最後一次奪冠時，他平均每場助攻3.5次，而這個數字在今年暴漲到5.2次。速度和彈跳明顯退步的喬丹平均每場貢獻22.9分，仍進入聯盟十大射手之列；去年12月，喬丹在同夏洛特黃蜂隊的比賽中射下本賽季最高的51分，兩天後喬丹再以45分的優異表現幫助奇纔隊戰勝新澤西網隊。此後，喬丹以39歲的高齡入選今年的全明星賽。

　　這一年裡，喬丹讓奇纔隊做起了季後賽的好夢，在全明星賽前，奇纔隊取得5連勝，排名位居東區聯盟第五，而在去年12月，奇纔隊更是驚人的連勝9場，喬丹平均每場射下20.1分。奇纔隊隊員說：『他讓我們學到的是，即使狀況不佳，也要咬牙堅持下去，他讓我們做起了季後賽的夢，這在去年是不可想象的。』

　　苦澀

　　喬丹接受了其籃球生涯中的第一次手術，由於膝傷嚴重，喬丹於2月27日對其右膝軟骨進行了修復手術，並在傷病名單中修養了12場，自加入NBA以來，這是喬丹第二次被列入傷病名單。在喬丹膝傷康復後的7場比賽中，他有3場得分未過10分，其中在4月2日與湖人隊的交鋒中，喬丹出場12分鍾，5投1中得到了職業生涯最低的2分，這場比賽也成為促使喬丹決心退出本賽季的導火索。

　　結發12年的妻子胡安妮塔以『要籃球就別要家庭』的態度向法庭提出上訴，要與喬丹離婚，雖然兩口子最終言歸於好，但這已讓此前被人看作典范的喬丹婚姻生活蒙上陰影。